Katja Beer erhielt ihre Ausbildung in Hamburg und New York bei Sabine Kirchner, P. Elkus und Richard Harrol (Juilliard School) und besuchte Meisterkurse bei Iena Cotrubas, Galina Wishnevskaja und Harry Kupfer.

Seit ihrem Diplom arbeitete sie als Opern- und Konzertsängerin in Deutschland, Österreich, der Schweiz und den USA. Ihr Opernrepertoire umfasst Partien wie die der Fiordiligi (Così fan tutte), Donna Anna (Don Giovanni), Marie (Verkaufte Braut) oder der Agathe (Der Freischütz). Im Sommer 1998 debütierte sie an der Komischen Oper in Berlin mit der Lucille in Lullys „Der Bürger als Edelmann“, danach war sie dort als Bessie im „Mahagonny Songspiel“ zu sehen.

Ein weiterer Schwerpunkt ihres Repertoires sind zeitgenössische Kompositionen. Die Oper Kirisk von Margret Wolf, bei der sie die Titelpartie sang, wird im Frühjahr 2002 bei Ars Nova erscheinen.

Mit dem Klarinettisten Giora Feidmann arbeitet sie fest zusammen. Zwei CDs wurden gemeinsam produziert: „The Soul Chai“ und „Schubert und jiddische Lieder“. Mit Feidmann trat sie u. a. in der Berliner Philharmonie in einem Festkonzert zum 50. Jubiläum des Staats Israel auf.